国产精品99久久久久久,91精品国产丝袜在线拍,欧美又粗又硬又大久久久,女同久久精品国产99国

您好,歡迎進入研域(上海)化學(xué)試劑有限公司網(wǎng)站!
一鍵分享網(wǎng)站到:
  • 公司動態(tài)NEWS

    您當(dāng)前的位置:首頁 > 公司動態(tài) > 利用Ion半導(dǎo)體測序開展基因表達譜分析

    利用Ion半導(dǎo)體測序開展基因表達譜分析

    發(fā)布時間: 2012-11-05  點擊次數(shù): 2803次

                 研究顯示雜交芯片可產(chǎn)生大約兩百萬個已定位的讀取[7],但也有研究證實,即使讀取數(shù)目過億,提高讀取數(shù)目仍然繼續(xù)增加其信息量 那么,究竟Ion PGM™測序儀生成多少個100 base讀取能相當(dāng)于一個基因表達微陣列芯片呢?在白皮書[9]中我們對Affymetrix GeneChip Human Genome U133 Plus 2.0 Arrays (HG-U133 Plus 2.0)的芯片質(zhì)量控制(MAQC)的微陣列數(shù)據(jù)與Ion PGM™系統(tǒng)生成的RNA-Seq數(shù)據(jù)進行了比較。圖1顯示了Ion PGM™測序儀數(shù)據(jù)按照不同檢測閾值下所得的基因數(shù)和微陣列芯片所能檢測到的基因數(shù)。當(dāng)采用zui嚴謹?shù)臋z測閾值即每個基因≥10讀取時,兩百萬個來自Ion PGM™測序儀的已定位讀取所能檢測到的基因數(shù)超過了微陣列芯片能檢測的基因。

                 當(dāng)讀取計數(shù)閾值放寬到≥5讀段數(shù)/基因時,僅僅1百萬個Ion RNA-Seq已定位讀取所能檢測到的基因數(shù)就超過了芯片的基因檢測數(shù)。利用來自Ion PGM™測序儀的2百萬個平均讀取所能檢測到的顯著差異表達基因數(shù)(sig DEGs)要多于微陣列芯片所能檢測到的sig DEGs數(shù)。在p ≤0.05和倍數(shù)變化f≥2標(biāo)準(zhǔn)下,在HBRR和UHRR樣本中Ion PGM™測序儀得到的sig DEGs數(shù)為4,630,而相比之下芯片得到的sig DEGs數(shù)為4,198將Ion PGM™測序儀生成的兩百萬個已定位讀取所產(chǎn)生的基因差異表達結(jié)果與qPCR結(jié)果相比較,發(fā)現(xiàn)qPCR 和RNA-Seq得到的sigDEGs倍數(shù)變化的對數(shù)值的Pearson相關(guān)系數(shù)(R)超過0.95。

                 在Ion PGM™平臺進行RNA-Seq實驗的另一個優(yōu)勢在于,能夠應(yīng)用ERCC RNA Spike-In Mix對轉(zhuǎn)錄本檢測靈敏度進行評估。這些ERCC轉(zhuǎn)錄本混合物是一些含多聚腺苷酸化且無標(biāo)記的RNA,該混合物經(jīng)過美國國家標(biāo)準(zhǔn)技術(shù)研究所(NIST)鑒定,是評估RNA測量系統(tǒng)性能的工具,能控制實驗可變因素。這些ERCC轉(zhuǎn)錄本的GC含量經(jīng)過平衡,更貼近真核生物內(nèi)源性mRNA的特征,它們的長度范圍在250 到2,000個核苷酸之間。ERCC轉(zhuǎn)錄本混合物的含量構(gòu)成經(jīng)特殊設(shè)計,能代表一個大動態(tài)范圍的表達水平。ERCC ExFold RNA Spike-In Mix可用于評估基因差異表達的檢測靈敏度。這些質(zhì)控RNA使用戶得以直接評估文庫質(zhì)量、檢測靈敏度、動態(tài)范圍以及表達倍數(shù)變化。劑量響應(yīng)散點圖顯示,ERCC相對濃度的對數(shù)值與已定位讀取數(shù)的對數(shù)值呈線性關(guān)系(圖2)。利用這些外部RNA質(zhì)控有助于將來自合作實驗室所產(chǎn)生的結(jié)果進行直接比較。

產(chǎn)品中心 Products
在線客服 聯(lián)系方式

服務(wù)熱線

021-54479081
021-54461587

国产好吊看视频在线观看| 国产精品高潮久久久无码| 无码日本精品久久久久久| 国产精品大秀视频日韩精品| 日韩精品中文字幕国产一| 亚洲成人一区二区三区性色| 青青久在线视频免费观看| 亚洲成人啪啪啪在线观看| 在线观看免费人成视频| 中文字幕日韩高清在线视频| 国产大学生午夜视频网站| 99香蕉国产精品偷在线观看| 日韩亚洲中文错码电影院| 国产亚洲精品精品国产亚洲综合| 国产免费无遮挡在线观看| 91青娱乐在线| 日韩精品人妻无码久久久| 中文字幕在线视频日韩精| 成人精品色一区二区三区| 欧美一级久久久久久国产| 中文字幕第一区二区三区| 亚洲福利在线观看视频网站| 男生女生骚鸡巴日本亚洲| 久久 中文字幕 一区二区| 在线观看日本十八禁免费| 加勒比在线观看日本一区| 欧亚日韩在线一区二区三区 | 鸡巴操巴子视频在线观看| 亚洲成aⅤ人片在线观看| 日韩电影在线播放中文字幕| 青青草原亚洲| 两性色午夜视频免费播放| 啦啦啦资源在线观看视频| 国产激情无码一区二区三区| 日韩av大片一区二区三区| 亚洲精品国产成人av…| 无码又爽又刺激a片涩涩动漫| 欧美人与牲交@欧美精品| 日韩视频一区二区三区网站| 亚洲色成人影院影音先锋| 91精品国产|